2024-fw-003--免规测序服务采购公告

一、采购项目名称：（略）
采购人：（略）
采购项目名称：（略）
（略）：2024-FW-003；
资金来源：财政资金。
二、项目内容
（一）菌株全基因组测序：30次。
1．样本类型和数量：纯化后的细菌6株
2．DNA提取：采用SDS或STE的方法对样本的基因组DNA进行提取，之后利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的纯度和完整性，利用Qubit进行定量。
3．文库构建：经电泳检测合格的DNA样品用Covaris超声波破碎仪随机打断成长度约为350bp的片段。处理完成后的DNA片段，使用NEBNext®Ultra™DNALibraryPrepKitforIllumina(NEB,USA)试剂盒，经末端修复、加A尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。
4．文库检测：文库构建完成后，先使用Qubit2.0进行初步定量，稀释文库至2ng/ul，使用Agilent对文库的插入片段进行检测，insertsize符合预期后，使用Q-PCR方法对文库的有效浓度进行准确定量，以保证文库质量。
5．（略）：使用illuminaNovaSeqPE150上机测序，（略）；
6．数据质量：原始下机数据测序质量要求:Q20≥90%，Q30≥85%；
7．数据量：rawdata≥1G/样本；
8．数据交付：需要交付cleandata；
9．周期要求：需要保证项目可加急得到响应，二代测序仪充足≥15台；
10．生物信息学分析内容：
①原始下机数据处理:过滤测序质量值低的reads，保留高质量reads，得到CleanData；
②样品组装:进行基因组组装，得到能反映样品基因组基本情况的序列文件，并对组装结果进行评价；
③基因组组分分析组装完成后，分析样品基因组的成分，包括编码基因、非编码RNA、重复序列、前噬菌体、基因岛、CRISPR等基因组成分的预测；
④功能注释针对编码基因序列进行不同数据库的功能注释，包括常用的KEGG、COG数据库、针对病原微生物的数据库；
⑤基因组比较分析此步骤从基因组、基因两层面分别比较样品与参考基因组的差异，包括共线性分析、基因家族构建、共有/特有基因分析、物种进化树构建。
（二）一代测定服务：400反应。
1．样本为PCR产物和引物，PCR产物未纯化，引物浓度为20μM。
2．★一代测定服务包括：（略）实验室完成，对PCR产物纯化，并按照送样者要求的长度进行基因序列测定。将测序结果以图谱形式反馈。
3．★PCR产物纯化方式：（略）
4．测序要求：双向或者单向，送检单会标明。
5．测序序列质量：一个正常的成功反应，能保证测序色谱图文件（*.abi）峰形清晰，无杂峰，峰值明显。
6．★提供的结果为：测序色谱图文件（*.abi）、终序列、拼接序列（*.fas或*.fasta）。结果反馈地点：（略）
7．检测中使用的试剂和耗材均需为优质无菌。
8．开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求，具备生物安全柜。
9．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。
10．★服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。
11．样本交接：根据采购方的要求，（略）不定期进行标本交接。
12．（略）未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。
（三）提供的成果
包含但不限于：出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称：（略）
（四）提交服务成果时间
收到样本并质检合格后，一代测定服务于3～8个工作日内完成检测并返回结果；菌株全基因组测序于30个工作日内完成所有项目分析内容。售后服务包括能提供现场报告解读。若样本未检出或峰图有杂峰等无法分析，重测也如此，视为此次测序无效，采购方将不支付相应费用。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用，并追究样本损失。
（五）其他要求：
1．开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求，具备生物安全柜。
2．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。
3．★服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。
4．样本交接：根据采购方的要求，（略）不定期进行标本交接。
5．（略）未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。
①PCR产物测序使用的试剂应具备中华人民共和国医疗器械注册证（体外诊断试剂）或者为成熟的商业化试剂盒，（略）。
②实验过程必须严格按照试剂说明书进行操作；在PCR产物质量过关的前提下，中标供应商须对每批样本测序实验进行质控，不可出现实验交叉污染、样本弄混等严重错误；出现此类错误导致的一切成本损耗皆由其负责。
③参与投标的供应商须具备纯化PCR产物的能力，并保证PCR产物符合测序要求；接收到待检样本后至建库测序数据产出，应有严格的质控标准；具有短期处理大量样本，进行一代测序的经验；（略）。
④样本收取及运输管理：按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌（毒）种或样本运输管理规定》的运输管理规范进行标本运输，根据采购人：（略）
⑤采购人：（略）
⑥中标供应商应在样本接收后及时对PCR产物进行质检，将结果反馈给采购人：（略）
（六）服务地点：（略）
（七）采购预算：3.14万元，其中菌株全基因组测序为700元/株、一代测定为26元/反应。
（八）报价要求：包括：服务的价格；必要的保险费用和各项税金；运输、装卸、安装、调试、培训、技术支持、售后服务、税金及其它所有成本费用的总和。
采购项目的名称：（略）
（九）付款条件：按中标实际单价、实际检测并验收合格的份数进行结算。
（十）采购结果认定：满足采购需求的前提下最低价中标，超出预算的投标视为无效。
二、资格要求及条件
1.投标人须是国内注册企事业单位：（略）
2.检测实验室必须已开展测序服务实验（提供复印件，原件备查）并承诺独立完成本项目，不得转让或转包或分包。
3.投标人须符合《政府采购法》第二十二条规定的条件；
4.投标人在“信用中国”网站（（略）.cn）（略）（（略）.cn）查询相关供应商主体信用记录，将查询结果加盖投标人单位：（略）
5.服务工作周期：签订合同之日起到2025年5月31日。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用。
6.具有履行合同所必需的人员和专业服务能力；
7.国家法律、法规规定的其他要求；
8.验收方式：（略）
供应商提供的成果包含提供的成果包含出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称：（略）
9.付款方式：（略）
按实际检测份数及项目报价单价结算，采购人：（略）
10.其他：应统一按附件报价表进行报价，不能恶意低价投标。
11.投标人根据报价表填写拟采购项目相关信息及价格一同密封提交（资格要求及条件材料装订成册）。闭封袋密封处需加盖递交单位：（略）
三、投送材料截止时间、地点：（略）
1.截止日期：2024年5月31日下午16点；
2.截止地点：（略）
fw-003统一报价表.xlsx

（略）
2024年5月23日