01公告内容
02监督部门
河南中医药大学
河南中医药大学多组学测试化验采购项目单一来源采购公示,(
(略):),项目所
(略),及现场图,>20,片)。,转录组学,具备IS09001质量管理体系认证、IS014001环境管理体系认,2.3,包2,测序及分,证和IS018001职业健康安全管理体系认证的优先考虑。,析项目,3,技术参数,基本数据统计①去除接头序列、低质量序列得到reads,3.1,信息,②样品相关性,③表达量分布,④RNA分类,参考基因组比对,3.2,mRNA鉴定、定量分析,3.3,mRNA差异表达分析、聚类分析,3.4,云平台交付,4,包装,4.1,数据包,5,其他要求,数据分析:,1.统计学分析:韦恩图、PCA分析、热图、火山图、箱,线图分析、多组蛋白表达模式聚类:,2.蛋白功能分析:亚细胞定位分析、结构域分析、G0功,能分析、KEGG,6.1,通路分析、
(略)络分析、表型与组学关联分析(,WGCNA分析),3.质量控制:QC样本评价、组间样本鉴定评价、样本定,量波动评价、DIA,体系评价(色谱峰的平均数据点、Peakcapacity,峰容量、iRT的保留时间、ProteinFDR),以拷盘形式交付数据,最终数据提供后,可继续免费保,6.2,留数据3个月,售后及技术支持能够免费提供不限次数的评估后可实现,6.3,的售后生信分析指导服务,以达到符合项目结题及文章,发表之需求。,融合基因分析,仅限人,推荐数据量≥8Gbcleandata,5.1,生信人员需要根据建库方法(链特异,5.2,性文库/非链特异性文库),来设置正确的分析参数,5.3,150个样本数据完成,分析周期为20个工作日以内,6,技术服务,对于转录组resequencing,.首先,我们过滤掉低质量,reads、接头污染以及未知碱基N含量过高的reads,获得,cleanreads。再将cleanreads,6.1,比对到参考基因组上,之后进行差异可变剪接基因检测。然,后计算基因表达水平。最后,对于多个样品根据需求检测不,同样品之间的差异表达基因,并对差异表达基因做深入的聚,类分析和功能富集分析等,6.2,云平台交付数据,售后及技术支持能够免费提供不限次数的评估后可实现的售,6.3,后生信分析指导服务,以达到符合项目结题及文章发表之需,求。,
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